Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO47Q5MNV8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms