Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms