Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P5Q59GN2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms