Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDCA8Q53HL2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.2 ms