Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCBP3Q53F19 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCBP3Q53F19 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCBP3Q53F19 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCBP3Q53F19 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCBP3Q53F19 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCBP3Q53F19 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCBP3Q53F19 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCBP3Q53F19 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCBP3Q53F19 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCBP3Q53F19 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCBP3Q53F19 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCBP3Q53F19 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCBP3Q53F19 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCBP3Q53F19 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NCBP3Q53F19 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NCBP3Q53F19 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCBP3Q53F19 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms