Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms