Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A12Q504Y0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A12Q504Y0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A12Q504Y0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms