Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX19Q49B96 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX19Q49B96 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms