Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms