Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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