Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-BQ31612 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-BQ31612 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-BQ31612 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-BQ31612 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-BQ31612 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-BQ31612 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-BQ31612 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-BQ31612 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-BQ31612 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HLA-BQ31612 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-BQ31612 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms