Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A8Q2Y0W8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A8Q2Y0W8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms