Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms