Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms