Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCB5Q2M3G0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB5Q2M3G0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms