Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KNOP1Q1ED39 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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