Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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RTL8BQ17RB0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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RTL8BQ17RB0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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RTL8BQ17RB0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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