Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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