Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCK2Q16822 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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