Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms