Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FXNQ16595 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FXNQ16595 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FXNQ16595 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FXNQ16595 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FXNQ16595 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FXNQ16595 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FXNQ16595 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FXNQ16595 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FXNQ16595 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FXNQ16595 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FXNQ16595 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FXNQ16595 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FXNQ16595 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FXNQ16595 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FXNQ16595 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FXNQ16595 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FXNQ16595 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FXNQ16595 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FXNQ16595 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FXNQ16595 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FXNQ16595 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FXNQ16595 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FXNQ16595 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FXNQ16595 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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FXNQ16595 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FXNQ16595 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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FXNQ16595 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FXNQ16595 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FXNQ16595 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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FXNQ16595 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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FXNQ16595 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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FXNQ16595 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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FXNQ16595 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FXNQ16595 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FXNQ16595 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FXNQ16595 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FXNQ16595 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FXNQ16595 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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FXNQ16595 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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