Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSRP2Q16527 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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