Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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