Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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