Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF11Q15544 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms