Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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