Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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