Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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