Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
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CNGB1Q14028 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
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CNGB1Q14028 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGB1Q14028 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
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