Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
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SHROOM2Q13796 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
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SHROOM2Q13796 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
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SHROOM2Q13796 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
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SHROOM2Q13796 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
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SHROOM2Q13796 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
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SHROOM2Q13796 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
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SHROOM2Q13796 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
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