Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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