Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF5Q13568 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF5Q13568 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
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