Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms