Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms