Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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