Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms