Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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