Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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