Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCB1Q12824 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
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