Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC36.84■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
HMGXB3Q12766 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
HMGXB3Q12766 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
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