Protein–RNA interactions for Protein: Q12507

SFG1, Superficial pseudohyphal growth protein 1, yeastyeast

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SFG1Q12507 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.38□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.38□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.38□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.38□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.38□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.38□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 RGM1YMR182C 636 nt2.38□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 BRX1YOL077C 876 nt2.38□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 ACM1YPL267W 630 nt2.38□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.38□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 POP7YBR167C 423 nt2.38□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 SWR1YDR334W 4545 nt2.38□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 YKR078WYKR078W 1758 nt2.38□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 LEU3YLR451W 2661 nt2.37□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 CTF13YMR094W 1437 nt2.37□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 snR83snR83 306 nt2.37□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 DAD1YDR016C 285 nt2.37□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 SPO11YHL022C 1197 nt2.37□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 PEX18YHR160C 852 nt2.37□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.37□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 RNP1YLL046C 750 nt2.37□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 GRX5YPL059W 453 nt2.37□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 ADF1YCL058W-A 342 nt2.37□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 ARP8YOR141C 2646 nt2.37□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.36□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 YJL070CYJL070C 2667 nt2.36□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 NPR3YHL023C 3441 nt2.36□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 TIF35YDR429C 825 nt2.36□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 GLC7YER133W 939 nt2.36□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 YJL202CYJL202C 348 nt2.36□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.36□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 VPH2YKL119C 648 nt2.36□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 MPP6YNR024W 561 nt2.36□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 KSP1YHR082C 3090 nt2.36□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 SNU114YKL173W 3027 nt2.36□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 PBP4YDL053C 558 nt2.35□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 PRE1YER012W 597 nt2.35□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.35□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt2.35□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 YIL082WYIL082W 873 nt2.35□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.35□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 MIX23YBL107C 591 nt2.35□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 UBP16YPL072W 1500 nt2.35□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 PDR1YGL013C 3207 nt2.35□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 YPR089WYPR089W 2667 nt2.35□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 YDR203WYDR203W 318 nt2.34□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.34□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 YET1YKL065C 621 nt2.34□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.34□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 RPL36AYMR194W 303 nt2.34□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 YOL150CYOL150C 312 nt2.34□□□□□ -2.03
SFG1Q12507 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.34□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.34□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.34□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 YCL020WYCL020W 1317 nt2.34□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 ROY1YMR258C 1662 nt2.34□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 KRE33YNL132W 3171 nt2.33□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 YCR099CYCR099C 468 nt2.33□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 GPI19YDR437W 423 nt2.33□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 HYP2YEL034W 474 nt2.33□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 RSM18YER050C 417 nt2.33□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.33□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 YJL086CYJL086C 369 nt2.33□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 CAP1YKL007W 807 nt2.33□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 OST2YOR103C 393 nt2.33□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.33□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 SUL1YBR294W 2580 nt2.33□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 NEW1YPL226W 3591 nt2.33□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.32□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 PDR11YIL013C 4236 nt2.32□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 YIP1YGR172C 747 nt2.32□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.32□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 YAP5YIR018W 738 nt2.32□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 SDS22YKL193C 1017 nt2.32□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 YNL046WYNL046W 519 nt2.32□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 JID1YPR061C 906 nt2.32□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 SLM4YBR077C 489 nt2.32□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 snR43snR43 209 nt2.32□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 YCL002CYCL002C 792 nt2.32□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 HRD3YLR207W 2502 nt2.32□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 KEL2YGR238C 2649 nt2.32□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 HSC82YMR186W 2118 nt2.32□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 CSF1YLR087C 8877 nt2.32□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 RPN3YER021W 1572 nt2.32□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 MLH1YMR167W 2310 nt2.31□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 PHO2YDL106C 1680 nt2.31□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 SVL3YPL032C 2478 nt2.31□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 NUP170YBL079W 4509 nt2.31□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 BET3YKR068C 582 nt2.31□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 URA5YML106W 681 nt2.31□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 YMR187CYMR187C 1296 nt2.31□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 YMR320WYMR320W 306 nt2.31□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 BNR1YIL159W 4128 nt2.31□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 YOL098CYOL098C 3114 nt2.31□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 HAA1YPR008W 2085 nt2.3□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 SIR3YLR442C 2937 nt2.3□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 TWF1YGR080W 999 nt2.3□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 YKL066WYKL066W 444 nt2.3□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 SAS2YMR127C 1017 nt2.3□□□□□ -2.04
SFG1Q12507 YBR197CYBR197C 654 nt2.3□□□□□ -2.04
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