Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms