Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms