Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms