Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN1BQ07699 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN1BQ07699 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms