Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms