Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FMODQ06828 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FMODQ06828 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FMODQ06828 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FMODQ06828 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FMODQ06828 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FMODQ06828 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FMODQ06828 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FMODQ06828 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FMODQ06828 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FMODQ06828 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FMODQ06828 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FMODQ06828 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FMODQ06828 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FMODQ06828 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FMODQ06828 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FMODQ06828 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FMODQ06828 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FMODQ06828 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FMODQ06828 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FMODQ06828 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FMODQ06828 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FMODQ06828 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FMODQ06828 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FMODQ06828 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FMODQ06828 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FMODQ06828 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FMODQ06828 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FMODQ06828 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FMODQ06828 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms