Protein–RNA interactions for Protein: Q06481

APLP2, Amyloid-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP2Q06481 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
APLP2Q06481 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
APLP2Q06481 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms