Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX1T1Q06455 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms