Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms